2451.
Surexploitée, la Terre a explosé et s'est fragmentée en millions d'îlots dérivant dans le ciel : le Skyland. Dans cet univers où l'eau est devenue rare et précieuse, une terrible dictature, la Sphère, emprisonne ceux qui revendiquent leur liberté. Parmi les résistants, Mila est enlevée pour avoir défié le tyran. Ses deux enfants, Mahad, véritable tête brûlée et pilote d'élite, et Léna, jeune Senjin aux pouvoirs incomparables, partent alors à sa recherche...